Vụ hiếp dâm trẻ em lần thứ hai của Quân diễn ra vào sáng 3/1/2004. Sau khi chầu nhậu, Quân giở trò đồi bại với một bé gái 9 tuổi. Gia đình nạn nhân làm đơn tố cáo và ngày 26/1/2004 hắn bị bắt.
Theo Người Lao Động, Phan Tấn Quân là đối tượng coi thường pháp luật ở địa phương. Sau lần được trả tự do năm 1993 (chấp hành xong án tù 4 năm), Quân không hối cải, tu chí làm ăn mà tiếp tục phạm pháp. Năm 1997, đối tượng bị TAND thị xã Tuy Hòa phạt 2 năm tù do gây rối trật tự công cộng và chống người thi hành công vụ.
