Ngày 7/11, ông Quân và Nguyễn Văn Lợi (35 tuổi, Giám đốc Công ty TNHH Thương mại Dịch vụ Sản xuất Nguyễn Tâm) bị Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an khởi tố, bắt tạm giam về hành vi Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng, theo Điều 222 Bộ luật Hình sự.
Lệnh khám xét nơi ở và làm việc của hai bị can được thực thi vào chiều 7/11.
Sau quá trình điều tra, nhà chức trách xác định ông Quân thông đồng, cấu kết với Lợi để thực hiện trái quy định của Luật đấu thầu trong việc mua sắm vật tư trang thiết bị y tế tại Bệnh viện TP Thủ Đức. Hành vi của hai người này được cho là "gây thiệt hại nghiêm trọng" tài sản Nhà nước. Sai phạm cụ thể chưa được công bố. Ngoài hai bị can trên, Bộ Công an đang mở rộng điều tra, làm rõ vi phạm của những người liên quan, thu hồi tài sản cho Nhà nước và người bệnh.
Ông Nguyễn Minh Quân được bổ nhiệm làm Giám đốc Bệnh viện quận Thủ Đức (nay là Bệnh viện TP Thủ Đức) từ năm 2007, khi mới 34 tuổi. Chỉ sau hai năm ông Quân làm giám đốc, bệnh viện được nâng cấp từ hạng ba lên hạng hai, với 23 chuyên khoa. Năm 2015, bệnh viện trở thành đơn vị tuyến quận huyện duy nhất cả nước được xếp hạng một. Năm 2019, Bệnh viện TP Thủ Đức TP HCM tiếp tục trở thành bệnh viện quận đầu tiên cả nước được giao nhiệm vụ "chỉ đạo tuyến".
Ngoài nhiệm vụ "chỉ đạo tuyến", Bệnh viện TP Thủ Đức còn được Bộ Y tế cho phép thực hiện chế độ luân phiên có thời hạn với người hành nghề tại cơ sở khám chữa bệnh trên địa bàn TP HCM và các tỉnh, thành phố khu vực Đông Nam Bộ, Tây Nam Bộ và miền Trung - Tây Nguyên.
Ông Quân được đánh giá là người có đóng góp lớn trong việc nâng tầm bệnh viện này.
Đông Vũ