Bản án kỷ luật ấy bắt nguồn từ trận thua 0-1 của SLNA trước Đồng Tháp ở vòng 11 V-League. Bàn thua duy nhất của SLNA do lỗi của Dương Hồng Sơn: nhận bóng của đồng đội trả về bên trong vòng 16,50m, thay vì co chân sút mạnh lên phía trước, Hồng Sơn lại cố tình dùng chân để lừa bóng qua tiền vệ đội trưởng Duy Quang (Đồng Tháp). Với kinh nghiệm trận mạc dày dặn và có được đôi chân khéo léo hơn đối phương chuyên xử lý bóng bằng đôi tay, Duy Quang cướp được bóng và sút vào lưới trống!
Phiên họp xử lý kỷ luật với Hồng Sơn kéo dài từ chiều đến gần 20giờ tối 29/4 với sự tham dự của đầy đủ các quan chức lãnh đạo ngành TDTT, lãnh đạo CLB và Ban huấn luyện. Trước các quan chức dự họp, Hồng Sơn đã thừa nhận sai phạm dẫn tới bàn thua nói trên và chấp nhận hình thức kỷ luật nội bộ.
Đi ngược lại dòng thời gian, để mắt đế những trận thua của đội SLNA sẽ thấy ngay rằng người giữ thành của đội xứ Nghệ là tác nhân chính dẫn tới những trận thua ấy. Ở trận bán kết cúp quốc gia mùa rồi tại Vinh, Hồng Sơn cố tình đánh cùi chỏ vào mặt một cầu thủ Thể Công, dẫn tới việc đội nhà bị quả phạt 11m (Thể Công gỡ hòa và thắng ngược lại 2-1), còn mình thì bị truất quyền thi đấu. Hành động sai trái này dẫn tới việc Sơn và một số cầu thủ khác như Quốc Vượng, Tân Thịnh, Sĩ Sơn cùng Thanh Thưởng lãnh án kỷ luật của SLNA và của VFF. Với án kỷ luật như trên, Hồng Sơn chính thức bị loại khỏi danh sách đội tuyển chuẩn bị cho Tiger cup 2004.
Bước vào V-League 2005, trong trận thua 1-3 ở vòng 2 trước Hoàng Anh trên sân Pleiku, Hồng Sơn đã chọn vị trí sai và ra vào không hợp lý khi Hoàng Anh thực hiện quả đá phạt góc. Từ pha đá phạt này, Hoàng Anh dễ dàng mở tỷ số. Hai bàn thua sau đó cũng có lỗi của Sơn khi anh phản xạ thiếu quyết đoán và không làm chủ được khu vực 16,50m.
Sang đến vòng 3, Hồng Sơn xin được ngồi ngoài không thi đấu với Bình Định với lý do đau vai trong khi tập luyện rất tốt trong thời kỳ chuẩn bị. Cũng với lý do đau vai như vậy, Hồng Sơn tiếp tục xin ngồi ngoài ở vòng 4 trước Hòa Phát. Tuy nhiên kết quả kiểm tra y học tại Hà Nội cho thấy chấn thương của Sơn có thật, nhưng không đáng ngại và hoàn toàn có thể thi đấu được ở V-League!
Qua đến vòng 6 V-League, Hồng Sơn tiếp tục phạm những sai lầm khó hiểu trước cầu môn đội nhà, vô tình giúp cho Hải Phòng có được hai bàn thắng trước lúc khép lại trận đấu này với tỷ số không tưởng: 4-4.
Theo Tuổi Trẻ, kKhông chỉ phạm sai lầm về chuyên môn trong thi đấu, Dương Hồng Sơn có không ít lần vi phạm nội quy của đội như uống bia rượu, đánh bài, tập trung trễ. Ở chặng đường đầu tiên của V-League 2005, Sơn là một trong số những cầu thủ tham gia xách động chống đối HLV Nguyễn Văn Thịnh.
