AFC quyết định không bốc thăm lại mà chuyển UAE từ bảng E (5 đội) sang bảng C (ba đội) để thế chỗ của Iraq. Như vậy, bảng E chỉ còn 4 đội gồm Hàn Quốc, Malaysia, Bahrain, Kyrgyzstan. Bảng C cũng trở lại số lượng 4 đội khi bên cạnh UAE là Trung Quốc, Timor Leste và Syria.
Như vậy, môn bóng đá nam Asiad 2018 chốt lại việc bốc thăm với 25 đội chia làm 6 bảng (bảng A có 5 đội, 5 bảng còn lại có 4 đội), thi đấu vòng tròn một lượt, chọn hai đội nhất nhì mỗi bảng cùng 4 đội hạng ba có thành tích tốt nhất.
Trước đó, Iraq tuyên bố rút lui khỏi giải và gửi lời xin lỗi: "Chúng tôi xin lỗi vì không thể cử đội dự Asiad ở Indonesia trong tháng 8/2018. Chúng tôi gặp khó trong khâu tuyển chọn cầu thủ, không có sự chuẩn bị tốt nhất. IFA cũng gửi thư xin lỗi ủy ban Olympic Iraq. Lý do quan trọng nhất là các CLB không chịu nhả cầu thủ vì bận dự giải quốc gia. Điều đó khiến chúng tôi thiếu quân trầm trọng".
Môn bóng đá nam bắt đầu thi đấu vòng bảng từ ngày 10/8, 8 ngày trước lễ khai mạc. Trận chung kết diễn ra ngày 1/9.