Vụ việc được phát hiện vào cuối tháng 2/2004 khi Công an quận Long Biên - Hà Nội phát hiện một ô tô của Công ty TNHH Minh Hồng chở 12.000 lít dầu ZA1 không có hóa đơn chứng từ. Tài xế Nguyễn Như Nhị khai đã lấy hàng từ kho N2 sân bay Nội Bài của XNXDHK-MB.
Theo Người Lao Động, năm 2002 - 2004, XNXDHK-MB ký hợp đồng bán nhiên liệu cho Công ty Minh Hồng, mỗi tháng 12.000 lít ZA1. Phía Minh Hồng giao Nguyễn Thanh Toàn quyền điều động tài xế Nguyễn Như Nhị đến kho N2 nhận hàng. Các nhân viên kho N2 như Đào Duy Hưng, Phạm Quang Nhiệm... bàn nhau và tìm cách bán dầu cho Minh Hồng không có hóa đơn chứng từ để lấy tiền chia chác. Vinapco xác định chỉ thất thoát 12.000 lít dầu ZA1. Còn lời khai thể hiện trong hồ sơ của các bị can là đã xuất bán 5 chuyến ô tô chở 60.000 lít dầu không hóa đơn chứng từ.
