Sữa chua ăn chứa ít đường và lactose hơn sữa chua uống, giảm nguy cơ đầy hơi hoặc tiêu chảy. Kết cấu đặc giữ lợi khuẩn lâu hơn trong ruột, mật độ lợi khuẩn thường cao hơn, giúp phục hồi cân bằng hệ vi sinh đường ruột. Nghiên cứu công bố trên Journal of Dairy Science (2018) và Nutrients (2020) cho thấy sữa chua đặc hỗ trợ tiêu hóa tốt hơn sữa chua uống.
Trong khi đó, sữa chua uống thường nhiều đường hơn, loãng hơn nên lợi khuẩn dễ trôi qua ruột nhanh, tác dụng cân bằng hệ vi sinh kém hơn.
Cuối cùng, sữa chua tách béo vẫn có lợi khuẩn, nhưng việc loại bỏ chất béo làm giảm khả năng hấp thu vitamin tan trong chất béo (A, D, E, K) - những chất giúp duy trì niêm mạc ruột khỏe mạnh và hỗ trợ miễn dịch. Ngoài ra, chất béo còn giúp làm chậm quá trình tiêu hóa, tạo điều kiện để lợi khuẩn lưu lại lâu hơn trong ruột, nên sữa chua tách béo không hẳn tối ưu cho người rối loạn tiêu hóa.