Lượng lợi khuẩn trong sữa chua tự làm không nhất thiết cao hơn sữa chua công nghiệp. Sản phẩm thương mại thường được kiểm soát chặt chẽ về số lượng lợi khuẩn và quy trình lên men.
Ngoài ra, sữa chua dù tự làm hay mua sẵn đều cần bảo quản lạnh. Để ở nhiệt độ phòng lâu sẽ khiến vi khuẩn có hại phát triển, làm giảm chất lượng và dễ gây rối loạn tiêu hóa.
