Theo bản di chúc, Giáo hoàng không để lại tài sản gì và yêu cầu tất cả giấy tờ cá nhân phải được thiêu hủy. Việc thực hiện yêu cầu này được giao phó cho 2 người còn sống: Thư ký riêng của Giáo hoàng và người đứng đầu giáo sĩ Do Thái của Rome, người từng đón tiếp ông tại thánh đường Hồi giáo năm 1986.
Giáo hoàng John Paul II cũng đã tính đến khả năng tổ chức tang lễ ở Ba Lan, nhưng sau đó dành quyền quyết định cuối cùng cho Hội đồng Hồng y giáo chủ. Theo đó, Giáo hoàng sẽ được mai táng ở nhà thờ Thánh Peter.
Giáo hoàng John Paul đã viết di chúc về quãng thời 26 năm làm Giáo hoàng, bắt đầu từ năm 1979. Bản di chúc này đã được viết bằng tiếng Ba Lan và được Vatican dịch sang tiếng Italy.
Giáo hoàng, khi đó mắc bệnh Parkinson và vừa trải qua một cuộc phẫu thuật, gợi lại thời gian này đúng là một sự dày vò với Ngài. Bản di chúc viết năm Ngài 80 tuổi cũng nhắc tới vụ ám sát hồi năm 1981. Giáo hoàng gọi việc Ngài sống sót sau vụ ám sát là một “điều kỳ diệu”.
Theo Tiền Phong, bí mật về việc Giáo hoàng John Paul II dự tính từ chức là một điều khá ngạc nhiên đối với nhiều người.
Trong thời gian bị ốm, Giáo hoàng luôn tạo cảm giác rằng làm Giáo hoàng là một nhiệm vụ mà Chúa giao cho Ngài và chỉ có Chúa mới có thể quyết định khi nào thì nhiệm vụ này mới kết thúc.
